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1、Monocle2|单细胞测序的拟时序分析(细胞轨迹分析伪时间是衡量单个细胞在细胞分化过程中进步多少的指标。在许多生物过程中，细胞并不完全同步。在单细胞的研究中表达在细胞分化的过程中，捕获的细胞可能在分化中广泛分布。也就是说，在同时捕获的细胞群中，有的细胞可能已经存在了很长时间，而有的细胞甚至还没有开始这个过程。当您想知道细胞从一种状态转换到另一种状态时发生的调控变化的顺序时，这种异步会带来很大的问题。

Monocle根据每个细胞在学习轨迹中的进度对其进行排序，从而缓解了异步带来的问题。Monocle不是跟踪表达随时间变化的函数，而是跟踪沿轨迹变化的函数，我们称之为伪时间。伪时间是一个抽象的微分单位:它只是从一个细胞到轨迹起点的距离，沿最短路径测量。轨迹的总长度由细胞从初始状态移动到结束状态所经历的转录变化的总量来定义。

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3、转录组表达差异分析在无生物学重复的情况下可以使用什么软件