paml进化分析 codeml 位点模型

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【paml进化分析 codeml 位点模型】
2、进化树构建需要哪些工具 Sequence comparison建议用ClustalX来构建NJ或者MP树，用MEGA就够了，非常方便。如果你想构建ML树，你应该使用phyML来构建Bayes树。如果不是专业成就，MEGA就够了。我建议参考下面这篇文章:一、引言在开始写这篇短文之前，我问自己，为什么要写这样一篇文章？写这样的文章有什么实际意义吗？

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4、phyml软件怎么使用一般在NCBI网站上通过BLAST搜索找到相似的序列就够了，你提交的序列应该是Fasta格式:> nameaattccggaattccgg关于构建进化树:ClustalX建议构建NJ或MP树， MEGA就够了。非常方便。如果要构建ML树，建议用phyML构建贝叶斯树。如果不是专业成就，MEGA就够了。建议参考以下文章:一、引言在开始写这篇短文之前，我问自己，为什么要写这样一篇文章？
我希望解决什么样的问题？带着这样的疑惑，我随便用关键词“进化分析求助”搜索丁香园(DXY)，居然有289个相关帖子(2006年9月12日) 。但用关键词“进化分析”和“进化”搜索，分别找到2733个和7724个相关帖子，考虑到部分帖子内容与分子无关进化，我这里保守估计大概3000 ~ 4 。